Smederevac / Getty
Βασικές επιλογές
- Τα σωματίδια του ιού COVID-19 ανιχνεύθηκαν κατά τη διάρκεια ρουτίνας δοκιμών λυμάτων των κοιτώνων στο Πανεπιστήμιο της Αριζόνα.
- Το σχολείο παρακολούθησε αμέσως εξετάζοντας μαθητές και προσωπικό και εντόπισε δύο άτομα που ήταν θετικά για το COVID-19 αλλά δεν είχαν συμπτώματα.
- Η ιστορία έκανε τους ανθρώπους να αναρωτιούνται γιατί περισσότερες κοινότητες δεν δοκιμάζουν ούρα και κόπρανα για το COVID-19.
- Οι ειδικοί λένε ότι το σύστημα δοκιμών έχει ήδη υπερφορτωθεί και η προσθήκη επιπλέον δειγμάτων θα προσθέσει μόνο στον αργό ρυθμό των αποτελεσμάτων.
Ενώ δοκιμάζει τακτικά λύματα κοιτώνων, το Πανεπιστήμιο της Αριζόνα εντόπισε στα δείγματα SARS-CoV-2, τον ιό που προκαλεί το COVID-19. Το πανεπιστήμιο ανταποκρίθηκε με άμεσα μέτρα για να σταματήσει μια πιθανή εστία, αλλά η ιστορία έθεσε ερωτήματα σχετικά με γιατί τα δείγματα ούρων και κοπράνων δεν έχουν ακόμη προστεθεί στις επιλογές δοκιμής COVID-19.
«Αυτό είναι πραγματικά πολύ νέο», λέει ο Aaron Peacock, PhD, διευθυντής μοριακής βιολογίας στο Microbac Laboratories, Inc. "Δεν έχει γίνει πραγματικά σε τακτική βάση ... οι περισσότερες από αυτές τις εταιρείες που κάνουν λύματα [δοκιμές] είναι οι εταιρείες κοινής ωφελείας μας, οπότε βρίσκονται σε πόλεις ή κομητείες ή είναι περιοχές κοινής ωφελείας και αυτοί" είναι πολύ ρυθμιζόμενο. "
Η Peacock δεν συμμετείχε στη δοκιμή λυμάτων κοιτώνων του Πανεπιστημίου της Αριζόνα, αλλά η Microbac Laboratories συνεργάζεται επί του παρόντος με άλλα κολέγια και πανεπιστήμια για να δοκιμάσει τα λύματα τους για τον ιικό αριθμό SARS-CoV-2.
Η εταιρεία συνεργάζεται επίσης με ορισμένες πόλεις και δήμους που έχουν διαθέσει χρηματοδότηση για δοκιμές SARS-CoV-2. Ο Peacock λέει ότι οι δοκιμές λυμάτων κατά τη διάρκεια μιας πανδημίας - και αλλιώς - μπορούν να συμπληρώσουν άλλες μεθόδους δοκιμών για να δώσουν στις πανεπιστημιουπόλεις, τις επιχειρήσεις και τις κοινότητες μια μεγαλύτερη εικόνα των μελλοντικών προβλημάτων.
Παρακολούθηση των κοινοτικών τάσεων μόλυνσης
Ο έλεγχος δειγμάτων λυμάτων για τον αριθμό των ιών COVID-19 είναι διαφορετικός από τον έλεγχο ενός ατόμου κάθε φορά. Διαφορετικά μοντέλα και αλγόριθμοι θα μπορούσαν να βοηθήσουν στην παρακολούθηση ενός γενικού αριθμού ενεργών λοιμώξεων σε μια περιοχή και τα δεδομένα θα μπορούσαν να βοηθήσουν στην ενημέρωση μιας κοινότητας σχετικά με το αν οι περιπτώσεις λοίμωξης ανεβαίνουν, πέφτουν ή παραμένουν οι ίδιες.
"Αν το κοιτάξετε με αυτόν τον τρόπο, ανεβαίνετε σε ένα μπαλόνι στα 10.000 πόδια, κοιτάζοντας προς τα κάτω το δάσος, δίνοντάς σας μια γενική ιδέα για το τι συμβαίνει στο δάσος. Αλλά όταν δοκιμάζετε μεμονωμένα άτομα, δοκιμάζετε μεμονωμένα δέντρα ", λέει ο Peacock.
Ο Peacock λέει ότι το SARS-CoV-2 μπορεί να ρίξει στα κόπρανα ενός ατόμου πριν εμφανίσει συμπτώματα.
«Είναι ένα είδος προ-αρπακτικού για το τι μπορεί να έρχεται κάτω από το λούτσο των ενεργών λοιμώξεων», λέει.
Με αυτή τη λογική, η ανίχνευση σωματιδίων ιού στα λύματα θα μπορούσε να βοηθήσει τις κοινότητες να εντοπίσουν τις περιπτώσεις COVID-19 νωρίτερα, όπως συνέβη στο Πανεπιστήμιο της Αριζόνα.
Το Κέντρο Βιώσιμης Τεχνολογίας Νερού και Ενέργειας του σχολείου δοκίμασε τα λύματα από τις αίθουσες διαμονής της πανεπιστημιούπολης κατά την πρώτη εβδομάδα των προσωπικών τάξεων. Βρήκαν την παρουσία του SARS-CoV-2 σε έναν κοιτώνα. Όταν δοκίμασαν τους μαθητές και το προσωπικό σε αυτήν τη θέση, εντόπισαν δύο άτομα που ήταν θετικά για τον ιό αλλά δεν είχαν συμπτώματα.
Στο πλαίσιο της στρατηγικής «Test, Trace, Treat» της πανεπιστημιούπολης, όλοι οι φοιτητές έπρεπε να έχουν ένα αρνητικό τεστ αντιγόνου πριν μπορέσουν να μετακινηθούν σε αίθουσες διαμονής, σύμφωνα με δήλωση του πανεπιστημίου.
«Είναι όλα σχετικά με το χρονοδιάγραμμα εδώ», λέει ο Jagdish Khubchandani, PhD, MPH, MBBS, καθηγητής δημόσιας υγείας στο Κρατικό Πανεπιστήμιο του New Mexico. «Νομίζω ότι σήμερα, αν με δοκιμάσεις, ελπίζω - και πιθανότατα - είμαι αρνητικός. Αλλά με αφήνεις μόνη για τρεις μέρες. Τις λίγες μέρες, ίσως πήγα στο τοπικό μανάβικο ή συνάντησα μερικούς ανθρώπους και μολύνθηκα. "
Πιάση περιπτώσεων πριν από τα συμπτώματα
Σύμφωνα με έρευνα της Johns Hopkins Medicine, όταν ένα άτομο δοκιμάζεται στις πρώτες μέρες μιας λοίμωξης COVID-19, το αποτέλεσμα θα μπορούσε να προκαλέσει ένα ψευδώς αρνητικό.
Για τη μελέτη, η οποία δημοσιεύθηκε στοΧρονικά της εσωτερικής ιατρικής, εξετάστηκαν δεδομένα από 1.330 δείγματα που υποβλήθηκαν σε δοκιμή αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης αντίστροφης-μεταγραφάσης (RT-qPCR). Οι ερευνητές υπολόγισαν καθημερινά ψευδώς αρνητικά ποσοστά χρησιμοποιώντας τα αποτελέσματα των δοκιμών και την αναφερόμενη ημερομηνία μόλυνσης ή τη στιγμή που εμφανίστηκαν τα συμπτώματα.
Σύμφωνα με τις εκτιμήσεις τους, τα άτομα που δοκιμάστηκαν για τον ιό κατά τη διάρκεια των τεσσάρων ημερών μετά τη μόλυνσή τους είχαν 67% περισσότερες πιθανότητες να δοκιμάσουν αρνητικά και συνεπώς να λάβουν ένα ψευδώς αρνητικό. Το τεστ αποδείχθηκε ακριβέστερο οκτώ ημέρες μετά τη μόλυνση, αλλά ακόμη και τότε, το ψευδώς θετικό ποσοστό ήταν 20%.
«Ακόμα και όταν μολύνομαι», εξηγεί υποθετικά ο Khubchandani, «αρχικά για τις πρώτες 7 έως 10 ημέρες - ή ακόμα και δύο εβδομάδες για μερικούς ανθρώπους - δεν έχω συμπτώματα, αλλά εξακολουθώ να συνεχίζω να ρίχνω τον ιό."
Το Πανεπιστήμιο της Αριζόνα μετεγκατέστησε τους δύο φοιτητές που έδειξαν θετικό COVID-19 από την αίθουσα διαμονής στην καραντίνα. Οι μαθητές θα συνεχίσουν τα μαθήματα τους στο Διαδίκτυο έως ότου μπορέσουν να επιστρέψουν με ασφάλεια στην κοιτώνα και στις προσωπικές σπουδές.
Μετά την απομόνωση των μαθητών, το Κέντρο Βιώσιμης Τεχνολογίας Νερού και Ενέργειας του σχολείου δοκίμασε ξανά τα λύματα του κοιτώνα και δεν βρήκε ίχνη ιού.
Εάν ο ιός απορρίπτεται σε σωματικά απόβλητα και μπορεί δυνητικά να χρησιμοποιηθεί για την ανίχνευση κοροναϊού νωρίτερα από τις δοκιμές COVID-19, όπως το ρινοφαρυγγικό επίχρισμα, τότε γιατί δεν εξετάζουν περισσότερα σχολεία και κοινότητες δείγματα ούρων και κοπράνων;
«Η ανάλυση ούρων θα αποτελούσε πρόσθετα βήματα και επιβάρυνση για τις δοκιμές», λέει ο Khubchandani. Με την αύξηση των δοκιμών και τις καθυστερήσεις από τα καθυστερημένα εργαστήρια ήδη ένα ζήτημα, η δοκιμή σωματικών αποβλήτων για άτομα θα ήταν μια επιπλέον πρόκληση.
Πώς να δοκιμάσετε τα λύματα για COVID-19
Η Peacock εξηγεί ότι η Microbac Laboratories λαμβάνει ένα αντιπροσωπευτικό δείγμα με έναν από τους δύο τρόπους. Το πρώτο είναι αυτό που ονομάζεται δοκιμή αρπαγής, όπου συλλέγεται ένα τυχαίο δείγμα. Το δεύτερο είναι μια σύνθετη δοκιμή, όπου ένα όργανο τίθεται σε εφαρμογή για τη συλλογή λυμάτων κάθε 15 ή 20 λεπτά.
Στη συνέχεια, το ρΗ του δείγματος ρυθμίζεται ώστε τα σωματίδια του ιού να κολλήσουν σε άλλα σωματίδια, τα οποία βοηθούν στο φιλτράρισμα. Στη συνέχεια, εκχυλίζονται νουκλεϊκά οξέα και πιθανό RNA ιού, και πραγματοποιείται δοκιμή RT-qPCR. Η δοκιμή "αλλάζει το RNA σε συμπληρωματικό DNA", λέει ο Peacock. "Και τότε αυτό το συμπληρωματικό DNA διαβάζεται από το όργανο μας."
RT-qPCR
Το RNA μετατρέπεται σε συμπληρωματικό DNA, μια συνθετική μορφή DNA που κατασκευάζεται από ένα πρότυπο RNA. Το τεστ έχει πολλές εφαρμογές, από τη γενετική έως την κλινική έρευνα.
Η δοκιμή RT-qPCR είναι η ίδια ανάλυση που χρησιμοποιείται για δείγματα που συλλέγονται από ρινοφαρυγγικά επιχρίσματα. Ωστόσο, χρειάζεστε μια άλλη μέτρηση για τον έλεγχο των λυμάτων. Το Microbac δοκιμάζει επίσης τον ιό ήπιου σπόρου πιπεριού (PMMoV).
«Αυτό είναι το πιο άφθονο ιού που σχετίζεται με τον άνθρωπο στα λύματα», λέει ο Peacock. Χρησιμοποιήθηκε επίσης για τον έλεγχο της ποιότητας του νερού. «Μπορείτε να χρησιμοποιήσετε αυτό το PMMoV για να σας ενημερώσουμε πόσα ανθρώπινα απόβλητα υπάρχουν στα λύματα ανά πάσα στιγμή», λέει ο Peacock, επικαλούμενος την ανάγκη διαφοροποίησης από την ανθρώπινη και τη βιομηχανική. "Και τότε μπορείτε να το χρησιμοποιήσετε για να επιβεβαιώσετε τα αποτελέσματά σας για τους αριθμούς SARS-CoV-2."
Δοκιμή πέρα από τους κοιτώνες
«Οι εταιρείες, οι βιομηχανίες, τα εργοστάσια και οι χώροι εργασίας μπορούν να είναι καλά μέρη για την εκτίμηση του φορτίου του ιού», λέει ο Khubchandani. Για παράδειγμα, κατά τους πρώτους μήνες της πανδημίας, τα φυτά συσκευασίας κρέατος έγιναν COVID-19 hotspots εστίας. Ο έλεγχος για την παρουσία του ιού στα λύματα ενός εργοστασίου θα μπορούσε να συμβάλει στην πρόληψη μελλοντικών εστιών.
Jagdish Khubchandani, PhD, MPH, MBBS
Νομίζω ότι αυτό που πρέπει να τονίσω είναι ότι η μεγαλύτερη πρόκληση για τον έλεγχο των λυμάτων ή των ανθρώπων είναι: πώς το μεταφράζετε σε δημόσια προσαρμογή;
- Jagdish Khubchandani, PhD, MPH, MBBSΟι πόλεις ενδέχεται επίσης να μπορούν να χρησιμοποιούν τον έλεγχο για να συλλέγουν δεδομένα από διαφορετικές υποενότητες μιας κοινότητας. "Όπου κι αν έχετε ένα σταθμό ανελκυστήρων (ένα αντλιοστάσιο) ή μια περιοχή όπου συγκεντρώνεται το νερό - [αν] πρόκειται για μια γειτονιά ή για ένα γυμνάσιο - μπορείτε να το δοκιμάσετε αυτό", λέει ο Peacock.
Τούτου λεχθέντος, η χρηματοδότηση και η γραφειοκρατία θα μπορούσαν να εξακολουθούν να αποτελούν εμπόδιο. "Σε μια μεγαλύτερη κατάσταση στην κοινότητα, υπάρχουν πολλές πρόσθετες δαπάνες για τον εμπλουτισμό του δείγματος για τη λήψη του σωστού τύπου ιικού φορτίου. Και πολλές πόλεις μπορεί να μην έχουν αυτούς τους τύπους πόρων. " Ο Khubchandani λέει.
Ο Khubchandani φέρνει επίσης ένα άλλο σημαντικό ζήτημα για τη συλλογή δεδομένων. «Νομίζω ότι αυτό που πρέπει να τονίσω είναι ότι η μεγαλύτερη πρόκληση για τον έλεγχο των λυμάτων ή των ανθρώπων είναι: πώς το μεταφράζετε σε δημόσια προσαρμογή;»
Εάν μια κοινότητα ανακαλύψει ένα υψηλό φορτίο COVID-19 μέσω δοκιμών λυμάτων, τότε θα έπρεπε να γίνουν πιο επιθετικά μέτρα κοινωνικής απόστασης και δοκιμές ατόμων εντός αυτής της κοινότητας.Ο Khubchandani προσθέτει ότι τελικά, τα δεδομένα είναι "χρήσιμα μόνο αν υπάρχει αξιολόγηση σε πραγματικό χρόνο και κοινοτική δράση καθοδηγούμενη από αυτήν την αξιολόγηση".
Τι σημαίνει αυτό για εσάς
Ενώ η κοινότητά σας ενδέχεται να μην δοκιμάζει τα λύματα της για το COVID-19 σύντομα, η ιστορία από το Πανεπιστήμιο της Αριζόνα είναι μια υπενθύμιση ότι ο ιός μπορεί να εξαπλωθεί ακόμα και όταν δεν έχετε συμπτώματα. Η συνέχιση των κατάλληλων προφυλάξεων κοινωνικής απόστασης, η χρήση της μάσκας σας και η αποτελεσματική υγιεινή των χεριών εξακολουθούν να είναι οι καλύτεροι τρόποι για να διατηρήσετε εσείς, την οικογένειά σας και την κοινότητά σας ασφαλή.
-interactions.jpg)
-to-treat-bedwetting-children.jpg)
